三層平台的結構代表佛教三乘法門：小乘、大乘、金剛乘。
頂端有金色法輪和雙鹿，法輪象徵佛陀常轉法輪，雙鹿象徵佛子隨佛聞法修學。白色圓點象徵智慧明點，是藏傳佛教寺院特有的紋飾。
這裡是後山門，未來善緣成熟時，如來殿正前方將闢一條成佛大道。

　　後山門最頂端，象徵法輪常轉、普傳十方的金色法輪雙鹿，正在台灣的晴空麗日下閃耀燦爛。平台之間嵌有兩面橫幅石坊，外題「寶塔山」「噶瑪噶居寺」，內題「慧日東舉耀三千」；內、外兩方，都是一題字、一留白，象徵著「有」與「無」。從有入無、從無入有，是佛法心要。後山門外，有無紛擾；進入後山門，超越有無。此乃邁向生命精華之道。後山門平台邊緣以赭紅色為底，鑲飾白色圓點，這代表密續奧義的「智慧明點」，是藏傳佛教寺院特有的紋飾。神秘就從稀奇開始。

內、外兩方橫幅石坊都是一題字、一留白，象徵「有」與「無」。